張掖黑河濕地國家級自然保護區區域內濕地資源豐富、植物繁茂，為野生鳥類繁衍生息創造了得天獨厚的條件，擁有國內最大規模的黑鸛繁殖種群和遷徙停歇種群，2023年11月入選我國《陸生野生動物重要棲息地名錄（第一批）》。

依據張掖黑河濕地候鳥繁殖與遷飛停歇規律，保護區規劃實施了《黑鸛等水鳥棲息地生境營造項目》。該項目針對黑鸛等水鳥的生活習性、取食方式等要素，在高臺縣天城湖濕地內采取自然恢復與適度人工干預相結合的方式，通過生態補水、微地形改造、水系連通、食源地營造、提升食物承載量及優化棲息地植物群落結構等一系列措施，促進形成穩定的、生物承載量豐富的、人為干擾少的濕地生境，吸引黑鸛等多種水鳥棲息覓食，打造針對黑鸛等水鳥的生物多樣性保護試驗區，為全面優化張掖黑河濕地黑鸛等水鳥的棲息生境，促進人與自然和諧共生提供經驗。目前，項目區累計監測到水鳥6目8科22種，其中包括黑鸛、東方白鸛、白琵鷺、大天鵝等國家重點保護鳥類4種，項目區鳥類種類和數量漸增，項目建設效益日趨顯現。